Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP35Q9NRY4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms