Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHRAC1Q9NRG0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRAC1Q9NRG0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms