Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NECTIN3Q9NQS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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