Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLRP1Q9C000 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms