Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021707.2-203ENST00000444381 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1P10-201ENST00000312966 496 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPHP1-205ENST00000418527 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG26-202ENST00000422542 1106 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP6-210ENST00000507557 542 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114781.2-201ENST00000515670 394 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL163195.2-203ENST00000553604 573 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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