Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDAC8Q9BY41 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms