Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms