Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms