Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIRIP3Q9BW71 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms