Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB2BQ9BVA1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms