Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CNPPD1Q9BV87 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms