Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTCH4Q99466 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTCH4Q99466 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTCH4Q99466 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NOTCH4Q99466 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTCH4Q99466 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms