Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms