Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms