Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP47Q96K76 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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