Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIRT1Q96EB6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms