Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REPS1Q96D71 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms