Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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RABGGTAQ92696 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGGTAQ92696 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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