Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBXN4Q92575 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms