Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms