Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf43Q8TAL5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms