Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD1Q8NHV4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD1Q8NHV4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms