Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C10orf53Q8N6V4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C10orf53Q8N6V4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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