Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTBP4Q8N2S1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTBP4Q8N2S1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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