Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC117Q8IWD4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms