Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PLD3Q8IV08 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms