Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms