Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms