Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
C16orf54Q6UWD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms