Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q6P435 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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