Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF220Q5VTB9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF220Q5VTB9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms