Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PRAMEF20Q5VT98 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAMEF20Q5VT98 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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