Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms