Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNT1Q5JUK3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNT1Q5JUK3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms