Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC93Q567U6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms