Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms