Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC39A12Q504Y0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms