Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC38Q502W7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC38Q502W7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms