Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ9

DEFB110, Beta-defensin 110, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB110Q30KQ9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB110Q30KQ9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms