Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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