Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LAMA3Q16787 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LAMA3Q16787 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LAMA3Q16787 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LAMA3Q16787 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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