Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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