Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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VPS72Q15906 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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