Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms