Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL19A1Q14993 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL19A1Q14993 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL19A1Q14993 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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COL19A1Q14993 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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