Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NFIXQ14938 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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NFIXQ14938 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIXQ14938 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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