Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IKBKEQ14164 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms