Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms