Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNC3Q14003 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms