Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms